Estimating the attack ratio of Dengue epidemics under time-varying force of infection
16 Abril 2015 ·
- Quem: Flávio Codeço Coelho
- Onde: FGV - Praia de Botafogo, 190, sala 317
- Quando: 16 de Abril de 2015 às 16:00h
Quantifying the attack ratio of disease is key to epidemiological inference and Public Health planning. For multi-serotype pathogens, however, different levels of serotype-specific immunity make it difficult to assess the population at risk. In this paper we propose a Bayesian method for estimation of the attack ratio of an epidemic and the initial fraction of susceptibles using aggregated incidence data. We derive the probability distribution of the effective reproductive number, Rt and use MCMC to obtain posterior distributions of the parameters of a single- strain SIR transmission model with time-varying force of infection. Our method is showcased in a data set consisting of 18 years of dengue incidence in the city of Rio de Janeiro, Brazil. We demonstrate that it is possible to learn about the initial fraction of susceptibles and the attack ratio even in the absence of serotype specific data. On the other hand, the information provided by this approach is limited, stressing the need for detailed serological surveys to characterise the distribution of serotype-specific immunity in the population.
Palestrante
Fávio Codeço Coelho Possui graduação em Biologia pela Universidade Federal do Rio de Janeiro (1992), mestrado em Engenharia Biomédica pela Universidade Federal do Rio de Janeiro (1995) e doutorado em Quantitative Biology - The University Of Texas At Arlington (1999). Foi Professor adjunto da Universidade do Estado do Rio de Janeiro (2001-2003) e Pesquisador Visitante da Fundação Oswaldo Cruz (2003 a 2008). Foi pesquisador a nível de pós doutoramento no Instituto Gulbenkian de Ciência, em Portugal, entre 2008 e 2010. Atualmente é Professor Associado da Escola de Matemática Aplicada da Fundação Getulio Vargas, onde desenvolve pesquisa na área de modelagem matemática, estatística e computacional de doenças infecciosas.
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